A Partiumi Területi Kutatások Intézete több hónapos előkészítést követően 2015 májusában alakult meg. A Partiumi Keresztény Egyetem szenátusának döntése alapján 2015. szeptembere óta része az egyetem struktúrájának. Az új, kiemelt státuszú kutatási egység létrehozásának célja, a Partium területét érintő regionális kutatások tudatos felvállalása, szervezése, a meglévő interdiszciplináris kutatási kapacitás egy rendszerbe való összefogása.
Az intézetnek az akadémiai szférából belső és külső, PKE-n kívüli tagjai is vannak. A PKE főállású tagjai mellett így több, Partiummal foglalkozó kutató jelentkezett a Debreceni Egyetem, az ELTE és a kolozsvári Babeş-Bolyai Tudományegyetem berkeiből is.